Ngày 14 tháng 4 năm 2016, Ủy ban nhân dân thành phố Hồ Chí Minh đã ban hành Quyết định số 12/2016/QĐ-UBND về Quy chế tổ chức và hoạt động của Sở Khoa học và Công nghệ TP.HCM. Quyết định này có hiệu lực từ ngày 24/4/2016.
.
Theo đó, Sở Khoa học và Công nghệ TP.HCM là cơ quan chuyên môn thuộc UBND Thành phố, có chức năng tham mưu, giúp UBND Thành phố quản lý nhà nước về khoa học và công nghệ, bao gồm: hoạt động khoa học và công nghệ; phát triển tiềm lực khoa học và công nghệ; tiêu chuẩn, đo lường, chất lượng; sở hữu trí tuệ; ứng dụng bức xạ và đồng vị phóng xạ; an toàn bức xạ và hạt nhân; quản lý và tổ chức thực hiện các dịch vụ công về các lĩnh vực thuộc phạm vi chức năng của Sở theo quy định của pháp luật trên địa bàn Thành phố.
.

Sở Khoa học và Công nghệ TP.HCM chấp hành sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức và hoạt động của UBND Thành phố, đồng thời chấp hành sự chỉ đạo, hướng dẫn, thanh tra, kiểm tra về chuyên môn, nghiệp vụ của Bộ Khoa học và Công nghệ. Sở Khoa học và Công nghệ TpHCM có tên tiếng Anh là Department of Science and Technology (viết tắt là DOST).
.

Sở Khoa học và Công nghệ có 7 phòng chức năng: Văn phòng, Thanh tra, Phòng Kế hoạch Tài chính, Phòng Quản lý Khoa học, Phòng Quản lý Công nghệ và thị trường công nghệ, Phòng Quản lý Khoa học và Công nghệ Cơ sở và Phòng Quản lý Sở hữu Trí tuệ;

Sở có 11 đơn vị hoạt động sự nghiệp, bao gồm:
.
1/ Trung tâm Thông tin Khoa học và Công nghệ
2/ Trung tâm Dịch vụ Phân tích Thí nghiệm
3/ Trung tâm Nghiên cứu và Chuyển giao Công nghệ
4/ Trung tâm Ứng dụng Hệ thống Thông tin địa lý
5/ Trung tâm Tiết kiệm Năng lượng
6/ Trung tâm Nghiên cứu Chế tạo Thiết bị Mới
7/ Chi cục Tiêu chuẩn Đo lường Chất lượng
8/ Tạp chí Thế giới Vi tính
9/ Tạp chí Khám phá
10/ Viện Khoa học và Công nghệ Tính toán
11/ Trung tâm Kỹ thuật Thành phố
.
Chi tiết về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn các phòng, đơn vị thuộc Sở, xem trên trang web của Sở Khoa học và Công nghệ TP. HCM hoặc xem toàn văn Quyết định 12/2016 tại Công báo TP.HCM./.